马铃薯基因组中Dof转录因子家族的鉴定与表达特征分析

• 作者: 吴智明 张圣旭 梁关生
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 马铃薯 Dof转录因子 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1260-1270
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2015.07.1260

摘要

Dof(DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在多种代谢途径中发挥着重要作用.为全面了解Dof基因在马铃薯基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了马铃薯Dof基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域进行了预测,分析了Dof基因在不同组织和系列胁迫下的表达特征.结果表明,马铃薯Dof转录因子家族由35个基因编码43个蛋白质;基因分布于除7号和12号染色体外的其余10条染色体上;STDOF蛋白长度在165 ～503个氨基酸之间,等电点介于4.72 ～10.04;系统发生分析表明,STDOF蛋白分为4个亚族;转录组数据分析显示,StDof基因的表达具有组织特异性,在不同胁迫条件下,多数StDof基因的表达也呈现有不同程度的差异.本研究为深入探讨StDof基因的功能及在马铃薯的遗传改良中的应用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁关生	仲恺农业工程学院园艺园林学院	19	148	6.0	11.0
2	吴智明	仲恺农业工程学院园艺园林学院	25	135	7.0	10.0
3	张圣旭	仲恺农业工程学院园艺园林学院	1	5	1.0	1.0