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摘要:
Dof(DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在多种代谢途径中发挥着重要作用.为全面了解Dof基因在马铃薯基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了马铃薯Dof基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域进行了预测,分析了Dof基因在不同组织和系列胁迫下的表达特征.结果表明,马铃薯Dof转录因子家族由35个基因编码43个蛋白质;基因分布于除7号和12号染色体外的其余10条染色体上;STDOF蛋白长度在165 ~503个氨基酸之间,等电点介于4.72 ~10.04;系统发生分析表明,STDOF蛋白分为4个亚族;转录组数据分析显示,StDof基因的表达具有组织特异性,在不同胁迫条件下,多数StDof基因的表达也呈现有不同程度的差异.本研究为深入探讨StDof基因的功能及在马铃薯的遗传改良中的应用奠定了基础.
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文献信息
篇名 马铃薯基因组中Dof转录因子家族的鉴定与表达特征分析
来源期刊 核农学报 学科
关键词 马铃薯 Dof转录因子 生物信息学 基因表达
年,卷(期) 2015,(7) 所属期刊栏目 植物诱变育种·农业生物技术
研究方向 页码范围 1260-1270
页数 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.11869/j.issn.100-8551.2015.07.1260
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 梁关生 仲恺农业工程学院园艺园林学院 19 148 6.0 11.0
2 吴智明 仲恺农业工程学院园艺园林学院 25 135 7.0 10.0
3 张圣旭 仲恺农业工程学院园艺园林学院 1 5 1.0 1.0
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马铃薯
Dof转录因子
生物信息学
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相关学者/机构
期刊影响力
核农学报
月刊
1000-8551
11-2265/S
16开
北京市海淀区圆明园西路2号农产品加工研究所
1987
chi
出版文献量(篇)
4988
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55367
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