口蹄疫病毒A/GDMM/CHA/2013株结构蛋白VP1 H-2d限制性CTL表位预测

• 作者: 冯霞 尚延丽 张晓霞 张柳 靳野 马军武
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 口蹄疫病毒 结构蛋白VP1 H-2d限制性T细胞表位 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（16）
• 所属期刊栏目: 动物科学·饲料科学
• 页码范围: 146-149
• 页数: 4页
• 分类号: S855.3
• 字数: 3742字
• 语种: 中文

摘要

[目的]预测A型口蹄疫病毒结构蛋白VP1的H-2d限制性T细胞表位.[方法]使用多种在线表位预测软件,包括Syfpeithi、IEDB、NetMHC-3.2、IMTECH和BIMAS预测A型口蹄疫病毒VP1上可能有的H-2d限制性T细胞表位,然后用ProtParam软件分析预测出的候选袁位.[结果]综合比较5个表位预测软件的预测结果,遴选出10个候选表位;再结合ProtParam软件分析结果,最后共预测出5个表位:其中H-2Kd限制性表位有第27 ～35、118 ～126位,H-2Ld限制性表位有第43 ～51位,H-2Dd限制性表位有第45 ～ 53、146～154位.[结论]预测出5条口蹄疫病毒结构蛋白VP1 H-2d限制性CTL表位,为进一步鉴定口蹄疫病毒CTL表位提供数据和基础.