基于RNA-Seq技术的苜蓿根蘖性状发生相关下调基因

• 作者: 王铁梅 郭云
• 来源期刊: 草业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 苜蓿 根系生长 生物信息学 脱落酸
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 植物生产层
• 页码范围: 75-85
• 页数: 11页
• 分类号: S551+.703|Q943.2
• 字数: 8389字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2015-0266

摘要

为了从分子水平上分析苜蓿(Medicago sativa)根蘖性状的发生机制,对根蘖型苜蓿的根蘖与非根蘖根部进行RNA-seq转录组文库构建,并分析差异表达基因及其功能.分别提取品系“BL-101”的根蘖型苜蓿根蘖与非根蘖部位总RNA,利用磁珠法分离mRNA后通过PCR扩增构建RNA-Seq转录组文库,并对差异表达基因进行分析,得到差异表达基因15 978条,本研究重点分析下调基因,通过生物过程分类,发现与根蘖性状发生有关的表达下调的基因为5个,经生物学信息分析确定,其中2个属于Lon蛋白酶家族,其余分别属于植物肌动蛋白酶家族,硫氧还蛋白和脂氧合酶,其与植物抗逆性相关,且与植物激素ABA的调控有关.研究结果可以为探讨苜蓿根蘖性状发生的分子机制提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王铁梅	北京林业大学林学院	34	281	11.0	15.0
5	郭云	北京林业大学林学院	1	6	1.0	1.0