荣昌猪肝组织全长cDNA文库的构建和EST测序及分析

• 作者: 杨滨宇 梅宏远 甘玲 黄庆洲
• 来源期刊: 云南大学学报（自然科学版）
• 学科: 政治法律
• 关键词: 荣昌猪 肝脏 全长cDNA文库 LD PCR SMART技术
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 生物
• 页码范围: 487-493
• 分类号: DF413.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.7540/j.ynu.20150537

摘要

研究旨在为荣昌猪种质资源的保存、开发和挖掘提供重要的分子信息,同时也为荣昌猪作为生物医学模型,代谢疾病的研究提供基础数据.运用SMART法构建了荣昌猪肝组织的cDNA文库,并从文库中随机挑取部分克隆进行EST测序和功能注释.经检测,构建的原始文库滴度为4.19×106 pfu/mL,重组率为96.31％,平均插入片段长度主要在400～2 000 bp之间.总共获得了226条有效EST序列,共计161个unigenes,包括19个重叠群(contigs)和142条单一序列(singlets).101(62.73％)条为已知功能基因序列,60(37.27％)条为未知功能序列,其中40条为新基因序列.GO分类和KEGG途径分析揭示大量荣昌猪肝组织表达基因主要与细胞质部分、细胞外的区域、受体结合,化学反应及细胞分解代谢过程等相关;表达的基因主要涉及代谢、补足物和凝固级联和核糖体等功能信号途径.研究采用SMART法成功构建了荣昌猪肝组织全长cDNA文库,并进行EST测序及分析,综览了荣昌猪肝组织基因表达及功能分类特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄庆洲	西南大学荣昌校区动物医学系	31	107	7.0	9.0
2	甘玲	西南大学荣昌校区动物医学系	15	17	1.0	4.0
3	杨滨宇	西南大学荣昌校区动物医学系	4	1	1.0	1.0
4	梅宏远	西南大学荣昌校区动物医学系	4	1	1.0	1.0