浙江地区猪戊型肝炎病毒全基因组序列分析

• 来源期刊: 检验检疫学刊
• 学科: 农学
• 关键词: 戊型肝炎病毒 全基因组序列分析
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究与探讨
• 页数: 1页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文

摘要

采用套式RT-PCR方法首次对浙江省猪群中戊型肝炎病毒的全基因组进行分段扩增,并对其两端非编码区采用末端快速扩增法进行扩增,T-A克隆测序后拼接分析.JH-14-03株全基因组共7253 bp,5'端至3'端依次为5'非编码区(25 bp)、ORF1基因(5124 bp)、ORF3基因(339 bp)、ORF2基因(1983)及包含一个18个碱基A组成的Poly(A)尾的3'非编码区(86 bp).JH-14-03株戊型肝炎病毒与已发表的基因4型戊型肝炎病毒全基因组核苷酸同源性最高,为85.6%-94.7%,显著高于与基因1、2、3型已发表戊型肝炎病毒全基因序列的同源性.分子进化分析显示JH-14-03株与大部分国内猪源和人源戊型肝炎病毒同属于戊型肝炎病毒基因4型毒株.