陆地棉ZF-HD蛋白的全基因组分析

• 作者: 倪万潮 徐珍珍 沈新莲
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 ZF-HD蛋白 生物信息 组织表达分析
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 519-526
• 页数: 8页
• 分类号: S562.03
• 字数: 3857字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201606001

摘要

ZF-HD (Zinc finger-homeodomain)蛋白属于同源异型盒蛋白家族,在动植物发育过程中起重要的作用.利用生物信息学的手段,研究陆地棉标准系TM-1基因组中ZF-HD蛋白的数目、亚细胞定位、染色体分布、基序、进化关系和组织表达情况.TM-1中共有35个GhZHD蛋白成员,且大部分成员定位到细胞核内;分布在20条染色体和2条Scaffold上,且具有11对直系同源基因;进化树分析表明,TM-1基因组中的ZF-HD蛋白大致分为6个小组,每个小组成员间具有类似的基序类型和排列顺序;大部分GhZHD基因在胚珠和纤维组织中表达,还有部分基因在根、茎、花、蕾和分生区中表达,在叶和愈伤组织中表达的基因最少.