11条白桦BpSPL家族基因的生物信息学和表达分析

• 作者: 宁坤 李慧玉 杨洋 马述山
• 来源期刊: 林业科学研究
• 关键词: 白桦 BpSPL基因家族 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 页码范围: 646-653
• 页数: 8页
• 分类号: S792.153
• 语种: 中文

摘要

[目的]研究白桦中SPL转录因子的基因序列特征及其在不同时期不同组织中的表达规律。[方法]依据白桦45个转录组测序结果，共获得12条全长SPL基因，依次命名为白桦BpSPL1-BpSPL12，对其中11条BpSPL进行了生物信息学及基因表达特征分析。[结果]生物信息学分析发现，11条BpSPL均含有1个高度保守的SBP结构域，且基因长度差异较大，含有210个不等数目的外显子，系统进化分析发现11条白桦SPL分属于六大类SPL蛋白；qRT-PCR分析结果显示，白桦BpSPL基因在不同时期的叶、顶芽、茎、雄花序中表达变化显著，多数SPL基因在顶芽中7月5日和8月20日至9月20日时期表达较高，除BpSPL1基因外在雄花序从6月份到9月份的生长阶段中， SPL的表达水平呈现逐渐升高的总体趋势。[结论]BpSPL基因可能参与到了白桦顶芽和雄花序的生长发育过程。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宁坤		1	4	1.0	1.0
2	杨洋		1	4	1.0	1.0
3	马述山		1	4	1.0	1.0
4	李慧玉		4	33	3.0	4.0