海雀稗SRAP-PCR分子标记体系优化及引物筛选

• 作者: 刘建秀 刘燕 史经昂 汪毅 王志勇 郭海林 马晶晶
• 来源期刊: 草地学报
• 学科: 农学
• 关键词: 海雀稗 SRAP标记 正交实验 体系优化 引物筛选
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1080-1086
• 页数: 7页
• 分类号: S544.9|Q75
• 字数: 4716字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11733/j.issn.1007-0435.2016.05.023

摘要

以4个代表性海雀稗(Paspalum vaginatum)种质的叶片DNA为模板,采用L9 (34)正交试验设计,对影响海雀稗SRAP-PCR反应的Mg2+、dNTP、引物和TaqDNA聚合酶的用量进行了优化,并比较了不同浓度模板DNA对扩增的影响,以确定适合海雀稗的SRAP-PCR最佳反应体系.结果表明:海雀稗SRAP-PCR最佳反应体系为10×PCR buffer 1 μL、模板DNA50 ng、Mg2+ 2.5 mmol·L-1、dNTP150μmol·L-1、引物0.4μmol·L-1、TaqDNA聚合酶1.0U,总体积10 μL.利用该反应体系从100对引物中筛选出可扩增清晰条带的引物83对,在83对引物中选出多态性丰富的引物44对.SRAP-PCR反应体系的优化及引物筛选,为今后利用SRAP标记技术进行海雀稗遗传多样性研究、基因定位、遗传图谱的构建以及分子标记辅助育种提供技术支持.