新型鸭细小病毒NS1基因的原核表达及生物信息学分析

• 作者: 刘光清 宫晓华 张经伟 朱杰 李传峰 李国新 李琦 温建新 陈宗艳
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 新型鸭细小病毒 克隆 原核表达 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 病毒
• 页码范围: 49-55
• 页数: 7页
• 分类号: S852.659.2
• 字数: 4842字
• 语种: 中文

摘要

为研究新型鸭细小病毒(Novel duck parvovirus,NDPV)NS1蛋白的生物学功能,根据NDPV DS15株NS1基因(GenBank登录号:KU947420)设计1对特异性引物,对NS1全基因进行PCR扩增,将PCR扩增产物克隆入pGEX-4T-1载体,构建重组质粒pGEX-4T-NS1,并进行测序鉴定.经鉴定正确后重组质粒转化到BL21感受态细胞,SDS-PAGE和Western blot进行表达鉴定.将测序获得NS1基因编码蛋白进行生物信息学分析.结果显示,本研究构建的重组质粒可在原核细胞中成功表达97 kDa的NS1融合蛋白.进一步生物信息学分析结果显示,NS1蛋白为酸性、可溶性蛋白,由627个氨基酸组成,分子质量约为72 kDa.该蛋白主要位于胞浆,不含信号肽序列,无跨膜区,含有丝/苏氨酸激酶底物模序和1个潜在磷酸化位点(s546),抗原表位主要集中在多肽的C端.NS1基因的同源性及系统发生树分析表明,NDPV与鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)处于同一进化分支,遗传进化关系最近.本研究结果为揭示NDPV NS1在病毒的复制、增殖以及致病机制中的作用奠定了基础.