全基因组预测褐环乳牛肝菌的分泌蛋白

• 作者: 任雪敏 刘艳 韩长志
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 褐环乳牛肝菌 全基因组 分泌蛋白 信号肽 预测程序
• 年，卷（期）: 2017,（23）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 45-48
• 页数: 4页
• 分类号: S182
• 字数: 3391字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2017.23.013

摘要

褐环乳牛肝菌作为针叶树种上重要的外生真菌,为宿主植物提供营养元素和水分,在此过程中,对于该菌分泌蛋白发挥的作用机制尚不清楚.利用SignalP、ProtComp等预测程序对褐环乳牛肝菌中18303条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,明确其含有327个分泌蛋白,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸大小分布、 信号肽长度、信号肽切割位点等进行分析,明确该菌分泌蛋白的氨基酸长度集中于51～450aa,信号肽长度以17～21 aa的序列最为集中,其信号肽切割位点均属于A-X-A类型.通过上述生物信息学分析方法有效地实现了褐环乳牛肝菌分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点类型与其他已经报道的致病疫霉、粗糙脉孢霉、禾谷炭疽菌等分泌蛋白信号肽切割位点一致.研究结果为进一步解析分泌蛋白在该菌为宿主植物提供营养过程中发挥的作用机制提供重要的理论支持.