植物MIo基因家族鉴定及系统进化分析

• 作者: 史建磊 陈伟哲
• 来源期刊: 温州科技职业学院学报
• 学科: 农学
• 关键词: 植物 MIO 鉴定 生物信息学 系统进化
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 19-26
• 页数: 8页
• 分类号: S642.2

摘要

为探究从低等到高等植物MIo基因结构及进化关系，本研究选取番茄、黄瓜、葡萄、拟南芥、水稻、玉米、江南卷柏，小立碗藓、绿藻等10个物种，运用生物信息学手段共鉴定出84个MIo基因。结果表明：绿藻MIo基因组明显比其他物种大，其次是玉米，江南卷柏最小；绝大部分MIo含11-16个外显子；绿藻MIo编码蛋白和组成氨基酸明显比其他物种大，其次是小立碗藓，水稻和玉米较小；所有MIo编码蛋白理论等电点均大于6，属碱性蛋白；绝大部分MIo蛋白含7个跨膜结构；12个MIo蛋白具有N端信号肽和钙离子结合区；大部分MIo定位于细胞膜。系统聚类可将84个MIo基因分为6类（Ⅰ-Ⅵ），其中最大的一类为I类，含有24个成员；Ⅲ类和Ⅵ类最小，分别含4和5个成员。进一步分析发现，共有27对同源基因，包括15对旁源基因和12对直源基因。本文初步对10种植物MIo基因进行了鉴定分析，这为植物MIo基因功能挖掘及抗病育种奠定了良好基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	史建磊		19	71	4.0	8.0
2	陈伟哲		1	0	0.0	0.0