橄榄CaICE1基因的克隆和表达分析

• 作者: 冯新 吴如健 程春振 赖瑞联 陈义挺 陈瑾 韦晓霞
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 关键词: 橄榄 抗寒 转录因子 ICE1 克隆 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 571-579
• 页数: 9页
• 字数: 4221字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11926/jtsb.3877

摘要

为了解橄榄(Canarium album)抗寒相关转录因子ICE1的调控功能,采用RT-PCR技术克隆了'福榄1号'的ICE1,命名为CaICE1,并进行生物信息学、qRT-PCR表达模式和相关miRNA预测分析.结果表明,CaICE1 cDNA序列的开放阅读框长度为1650 bp,可编码549个氨基酸(GenBank登录号MG459422).CaICE1为不稳定亲水性蛋白质,含有跨膜结构、磷酸化位点以及HLH保守结构域,定位于细胞核,与枳的ICE1亲缘关系较近.CaICE1密码子偏好性较弱,AGA、AGG、TGG和CCA可能为其最优密码子群.CaICE1主要在橄榄花、种子和叶中大量表达,-3℃低温胁迫下CaICE1表达水平比常温显著上升.psRNAtarget预测结果表明,CaICE1可能是miR825、miR477、miR5658、miR1436和miR394等多个逆境响应miRNA的靶基因.因此,CaICE1可能在橄榄低温胁迫过程中发挥重要调控作用,且可能受miRNA的调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韦晓霞	福建省农业科学院果树研究所	82	430	10.0	16.0
2	吴如健	福建省农业科学院果树研究所	71	550	12.0	20.0
3	陈义挺	福建省农业科学院果树研究所	62	358	11.0	15.0
4	陈瑾	福建省农业科学院果树研究所	47	225	9.0	13.0
5	程春振	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	34	53	4.0	6.0
6	冯新	福建省农业科学院果树研究所	29	68	5.0	6.0
7	赖瑞联	福建省农业科学院果树研究所	40	79	5.0	6.0