广叶绣球菌DASH型隐花色素同源基因Slcry1的序列与表达分析

• 作者: 应正河 杨驰 林衍铨 江晓凌 肖冬来 马璐
• 来源期刊: 食用菌学报
• 关键词: 广叶绣球菌 隐花色素 Slcry1 食药用菌
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 页码范围: 9-16
• 页数: 8页
• 字数: 4089字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16488/j.cnki.1005-9873.2018.04.002

摘要

用关键词“DNA photolyase (pfam 00875)”和“FAD binding domain of DNA photolyase (pfam 03441)”搜索广叶绣球菌(Sparassis latifolia)闽绣1号菌株基因组,找到一个候选基因——隐花色素同源基因Slcry1,PCR扩增得到该同源基因cDNA全长1755 bp,基因组全长为2279 bp;利用PROTPARAM预测SlCRY1蛋白含有584个氨基酸,相对分子质量为65800,等电点为8.94;利用SMART和Pfam预测其保守结构域,发现SlCRY1蛋白(584个氨基酸)包含一个DNA光解酶(DNA Photolyase)结构域和一个FAD结合(FAD binding)结构域;用MEGA7软件中的邻位相连法构建系统发育树,发现SlCRY1属于光解酶/隐花色素蛋白家族中的DASH(Drosophila,Arabidopsis,Synechocystis,and Homo species)型隐花色素;最后用荧光定量PCR检测该同源基因在广叶绣球菌不同发育阶段及光照处理下的表达量:在约300 lx白色LED光照下,基因Slcry1表达量随光照时间延长而增加;不同发育时期,Slcry1基因的表达水平为子实体＞原基＞菌丝.实验结果揭示:SlCRY1属于DASH型隐花色素,其表达量受到光照的诱导,且随广叶绣球菌的生长发育而上升.