花生14-3-3基因家族的生物信息学分析

• 作者: 姜焕焕 潘丽娟 王冕 王通 祁佩时 禹山林 迟晓元 陈娜 陈明娜
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 花生 14-3-3蛋白 生物信息学分析 逆境胁迫
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 501-507
• 页数: 7页
• 分类号: S565.2
• 字数: 4953字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2018.04.006

摘要

14-3-3是一类广泛存在于真核生物细胞内的多基因家族蛋白,在植物信号传导、生长发育及抗逆胁迫反应中发挥重要作用.本文通过隐马尔柯夫模型(hidden Markov model,HMM),对野生花生(Arachis duranensis和Arachis ipa?nsis)基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得Ad14-3-3基因家族成员14个,Ai14-3-3基因家族成员13个.进化树分析显示其主要分为 ε类和非 ε类,其中Ad14-3-3家族包含6个 ε类和8个非 ε类;Ai14-3-3家族包含了7个 ε类和6个非 ε类成员.进一步对该基因家族的理化性质、基因定位、基因结构及上游调控序列进行分析预测.结果显示,Ad14-3-3和Ai14-3-3基因家族的染色体定位相似,在1和6号染色体没有定位,在4和7号染色体上各有3个家族成员.花生中的14-3-3基因家族高度保守,ε类14-3-3蛋白主要包含6个外显子,非 ε类14-3-3蛋白主要包含3-4个外显子,ε类与非 ε类14-3-3蛋白的保守基序存在显著区别.上游调控序列预测分析表明,花生14-3-3蛋白存在大量的激素及逆境胁迫应答元件,预示着该基因家族参与花生的生理及逆境胁迫反应.