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牛NTM基因可变剪接体和印记状态分析
牛NTM基因可变剪接体和印记状态分析
作者:
张萃
徐达
李世杰
李俊良
李冬杰
陈玮娜
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
牛
Neurotrimin基因(NTM)
剪接体
印记状态
单核苷酸多态性(SNP)
摘要:
NTM (neurotrimin)在神经发育中具有重要作用,在人类(Homo sapiens)相关研究中是印记基因,但是在牛(Bos taurus)中的印记状态尚未揭示.本研究旨在分析牛NTM基因的序列特征和编码蛋白结构,并鉴定NTM基因在成年牛组织和胎盘中的印记状态.本研究首先应用cDNA末端快速扩增技术(rapidamplification of cDNA ends,RACE),得到1个牛NTM基因新的剪接体NTMxd (GenBank No.:MH037574),通过对其编码氨基酸序列进行分析,发现其N端具有完整的跨膜信号.为了分析NTM基因在牛中的印记状态,首先通过PCR产物直接测序法在牛NTM基因上发现1个单核苷酸多态性(single nucleotidepolymorphism,SNP)位点,GenBank登录号为rs42185569;然后提取杂合子牛胎盘和组织样本RNA,并进行反转录PCR (reverse transcription-PCR,RT-PCR).对扩增产物直接测序发现,NTM基因在牛胎盘中和成年牛组织中均为单等位基因表达.本研究结果表明NTM基因在牛中是印记基因,为深入研究NTM基因的功能和相关神经发育疾病提供了参考依据.
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组蛋白去乙酰化酶(HDAC)
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可变剪接
生物信息学
马身猪ZNF280D基因新型剪接体的鉴定及生物信息学分析
猪
ZNF280D基因
剪接体
内容分析
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内容分析
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(/年)
文献信息
篇名
牛NTM基因可变剪接体和印记状态分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
牛
Neurotrimin基因(NTM)
剪接体
印记状态
单核苷酸多态性(SNP)
年,卷(期)
2018,(10)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
1707-1713
页数
7页
分类号
S823
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2018.10.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李冬杰
河北科技大学生物科学与工程学院
49
432
11.0
19.0
2
李世杰
河北农业大学生命科学学院
36
214
7.0
13.0
3
陈玮娜
河北农业大学生命科学学院
8
54
2.0
7.0
5
张萃
河北农业大学生命科学学院
8
11
2.0
3.0
6
徐达
河北农业大学生命科学学院
4
3
1.0
1.0
7
李俊良
河北农业大学生命科学学院
3
2
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被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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二级引证文献(0)
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引证文献(1)
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研究主题发展历程
节点文献
牛
Neurotrimin基因(NTM)
剪接体
印记状态
单核苷酸多态性(SNP)
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
40364
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
河北省自然科学基金
英文译名:
官方网址:
项目类型:
学科类型:
期刊文献
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农业生物技术学报2001
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农业生物技术学报2018年第8期
农业生物技术学报2018年第7期
农业生物技术学报2018年第6期
农业生物技术学报2018年第5期
农业生物技术学报2018年第4期
农业生物技术学报2018年第3期
农业生物技术学报2018年第2期
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