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生物信息方法分析大豆Nodulin家族蛋白
生物信息方法分析大豆Nodulin家族蛋白
作者:
侯瑛倩
杨文娇
柴文静
王巍杰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大豆
Nodulin蛋白
模体
系统进化分析
摘要:
为研究大豆Nodulin家族蛋白特性,在数据库UniprotKB中下载大豆Nodulin蛋白序列,利用NCBI的BLAST程序进行同源序列比对筛选和Pfam数据库综合分析,确定14个大豆Nodulin家族蛋白,通过生物信息学方法对14个家族蛋白的基本理化性质、跨膜区域、模体、系统发育和蛋白结构等进行分析.结果显示:14条蛋白序列氨基酸数为72~ 116、理论等电点为9.94~11.59、分子质量为7 408.70 ~ 12 465.55、脂肪系数为85.94~ 114.12,除K7KNK4没有跨膜区外,其余13条Nodulin蛋白均有1~2跨膜区.二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,13个模体中模体1、模体2、模体3和模体4保守性强,系统发育进化树由6个分枝组成,分枝Ⅵ的A0A0B2P3C8、I1MWA0三维结构预测结果也相似.
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篇名
生物信息方法分析大豆Nodulin家族蛋白
来源期刊
大豆科学
学科
农学
关键词
大豆
Nodulin蛋白
模体
系统进化分析
年,卷(期)
2018,(1)
所属期刊栏目
遗传育种·分子生物学
研究方向
页码范围
39-44
页数
6页
分类号
S565.1
字数
语种
中文
DOI
10.11861/j.issn.1000-9841.2018.01.0039
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王巍杰
华北理工大学生命科学学院
10
11
3.0
3.0
2
杨文娇
6
28
2.0
5.0
3
柴文静
华北理工大学生命科学学院
1
0
0.0
0.0
4
侯瑛倩
1
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二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
大豆
Nodulin蛋白
模体
系统进化分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
大豆科学
主办单位:
黑龙江省农业科学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-9841
CN:
23-1227/S
开本:
大16开
出版地:
哈尔滨市南岗区学府路368号
邮发代号:
14-95
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3361
总下载数(次)
6
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