生物信息方法分析大豆Nodulin家族蛋白

• 作者: 侯瑛倩 杨文娇 柴文静 王巍杰
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 Nodulin蛋白 模体 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 39-44
• 页数: 6页
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2018.01.0039

摘要

为研究大豆Nodulin家族蛋白特性,在数据库UniprotKB中下载大豆Nodulin蛋白序列,利用NCBI的BLAST程序进行同源序列比对筛选和Pfam数据库综合分析,确定14个大豆Nodulin家族蛋白,通过生物信息学方法对14个家族蛋白的基本理化性质、跨膜区域、模体、系统发育和蛋白结构等进行分析.结果显示:14条蛋白序列氨基酸数为72～ 116、理论等电点为9.94～11.59、分子质量为7 408.70 ～ 12 465.55、脂肪系数为85.94～ 114.12,除K7KNK4没有跨膜区外,其余13条Nodulin蛋白均有1～2跨膜区.二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,13个模体中模体1、模体2、模体3和模体4保守性强,系统发育进化树由6个分枝组成,分枝Ⅵ的A0A0B2P3C8、I1MWA0三维结构预测结果也相似.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王巍杰	华北理工大学生命科学学院	10	11	3.0	3.0
2	杨文娇		6	28	2.0	5.0
3	柴文静	华北理工大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
4	侯瑛倩		1	0	0.0	0.0