养殖水体三种大型爆发性海洋藻类孢子/配子实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用初探

• 作者: 包卫洋 张倩倩 缪栋 苏蕾 龚骏
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 藻类爆发 石莼 萱藻 特异性引物 孢子 配子 ITS rDNA 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 68-76
• 页数: 9页
• 分类号: S946.3
• 字数: 7722字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20170139

摘要

一些大型海洋藻类在近海养殖环境中快速生长且容易形成青苔,严重威胁到养殖生物的安全并可能带来巨大的经济损失.检测青苔孢子的数量与动态,理解青苔爆发的环境生态学机制是防控与预警的基础.使用PCR方法,利用特异性引物对非爆发期的生物量进行检测,是监控有害藻类的有效方法.本工作针对海参养殖池塘三种常见的青苔藻(两种石莼Ulva cf.linza,Ulva sp.和萱藻Scytosi phon lomentaria)设计了以核糖体转录间隔区(ITS)为靶区域的种类特异性PCR引物,通过藻类和环境水样DNA对照实验检验其特异性和适用性.本工作建立了实时荧光定量PCR(qPCR)方法检测养殖水体中藻类孢子/配子体含量,并实验得出该方法在三种藻类中的最低检出量,可最低检出200～400 ITS rDNA拷贝.使用qPCR方法对烟台海参养殖水体2014年12月-2016年3月6个季度环境水样中的萱藻孢子/配子进行了定量检测,发现样品中萱藻孢子/配子ITS拷贝数的季节变化与青苔爆发规律呈现较高的吻合度,萱藻爆发前期伴随水体中孢子/配子量的增高,初步显示藻类爆发可用qPCR方法预测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张倩倩	中国科学院烟台海岸带研究所	11	28	3.0	4.0
2	龚骏	中国科学院烟台海岸带研究所	8	97	4.0	8.0
3	缪栋	扬州大学环境科学与工程学院	2	3	1.0	1.0
5	包卫洋	扬州大学环境科学与工程学院	7	52	3.0	7.0
8	苏蕾	中国科学院烟台海岸带研究所	1	2	1.0	1.0