菊芋实时定量PCR分析中内参基因的选择

• 作者: 孙雪梅 宋向阳 李莉 杨世鹏 王丽慧 赵孟良 钟启文
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 菊芋 实时荧光定量PCR 内参基因
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 标记辅助育种
• 页码范围: 1190-1196
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.016.001190

摘要

实时荧光定量PCR具有灵敏度、特异性和重复性好等优点,是植物中常用于基因表达和转录分析的重要手段.在分子生物学的研究中,选择表达相对稳定的内参基因是分析实时荧光定量实验数据的前提.本研究以菊芋(Helianthus tuberosus)开花时期的幼根、嫩茎、叶片、块茎和花瓣为材料,运用荧光定量PCR方法分析了18S rRNA、EF1 α、A ctin、β-actin、GAPDH、25S rRNA和UBQ57个内参基因的表达量,通过GeNorm、NormFinder和BestKkeeper软件的综合分析,发现25S rRNA的稳定性最好,可用于菊芋基因表达的内参基因.而GAPDH在不同样品中稳定性最差,不适合作为内参基因.本研究为菊芋实时荧光定量PCR中内参基因的选择提供了参考.