水芹咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶基因的克隆与表达特性分析

• 作者: 仇亮 冯凯 刘洁霞 徐德宝 朱胜琪 熊爱生 王永鑫
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水芹 OjCCoAOMT基因 序列分析 多重比对 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 植物科学
• 页码范围: 51-58
• 页数: 8页
• 分类号: S636.3
• 字数: 5965字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201802034

摘要

[目的]本文旨在研究水芹咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶基因(OjCCoAOMT)的序列及其表达特性,了解该基因在水芹木质素代谢中的作用.[方法]利用RT-PCR技术从水芹中克隆OjCCoAOMT基因,用生物信息学方法对获得的序列进行分析,并利用实时荧光定量PCR技术研究该基因在水芹不同组织以及不同贮藏条件下的表达.[结果]序列分析结果表明:OjCCoAOMT基因包含1个长度为726 bp的开放阅读框(ORF),编码241个氨基酸,蛋白相对分子质量为27.111×103,理论等电点为5.38.OjCCoAOMT蛋白属于疏水性蛋白,无序化比例为12.45％,空间结构主要由8个α-螺旋和7个β-折叠组成.多重比对与系统树分析结果表明:OjCCoAOMT蛋白与同科植物欧芹的进化关系最近.实时荧光定量PCR显示,在‘八卦洲水芹’和‘南选八卦洲紫水芹’的叶片及叶柄中OjCCoAOMT基因的表达量差异显著.在室温(25 ℃)、低温(4℃)和室温黑暗(25℃)3种贮藏条件下OjCCoAOMT基因表达量差异较大,低温(4℃)下表达量最高.2个品种的基因表达量也具有显著差异.[结论] OjCCoAOMT蛋白有较高的保守性.OjCCoAOMT基因在水芹中的表达具有明显的组织特异性和材料差异性,同时在低温(4℃)条件下表达量最高.