生物信息学深入分析糖尿病肾脏疾病的分子作用网络

• 作者: 吴镝 沈婉君 洪权 王旭 耿晓东 蔡广研 陈香美
• 来源期刊: 中华糖尿病杂志
• 关键词: 糖尿病肾脏疾病 基因表达谱 原癌基因ETS1 整合素β2
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 254-259
• 页数: 6页
• 字数: 5036字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1674-5809.2019.04.006

摘要

目的 利用糖尿病肾脏疾病(DKD)患者和小鼠模型肾脏基因组表达数据进行生物信息学分析,探寻DKD可能的致病机制及潜在治疗作用靶点.方法 从NCBI-GEO数据库选取DKD患者和DKD小鼠模型肾脏基因组表达数据,通过生物信息学软件进行综合分析,查找共同差异基因,然后进行基因本体论分析及创新途径分析(IPA)生物网络功能分析,寻找潜在作用靶点.结果 通过对人和小鼠DKD数据库的综合对比,筛选出了89个共同差异基因,差异基因主要富集位于细胞外区域、细胞外基质、细胞黏附、细胞浆膜等方面.通过IPA生物信息学分析,发现共同差异基因表达主要集中在补体系统通路、主要免疫缺陷信号传导通路和B细胞发育通路,其中补体系统通路是糖尿病肾病中一条重要的调节通路.疾病和生物功能富集分析显示DKD与糖尿病、葡萄糖代谢障碍、血细胞的移动、血细胞活化和白细胞迁移等存在密切的联系.IPA调控网络分析发现原癌基因ETS1和整合素β2(ITGB)两个重要作用位点.结论 利用DKD不同种属即人和小鼠肾脏基因表达谱数据库,可筛选DKD潜在的作用位点,通过生物信息学分析发现转录因子ETS1和ITGB可能在糖尿病肾病的疾病进程中发挥一定的作用.