玉米CCT基因家族的鉴定与生物信息学分析

• 作者: 周宝元 曹哲统 杜媚 赵明 郭栋 高卓晗
• 来源期刊: 植物遗传资源学报
• 关键词: 玉米 CCT 生物信息学分析 蛋白结构
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1001-1010
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20181107001

摘要

CCT(CO、COL和TOC1)家族基因广泛参与植物花期的调控过程,对植物的生长与发育起着至关重要的作用.本研究以玉米为材料,共鉴定出57个CCT基因,命名为ZmCCT1～ZmCCT57,利用生物信息学方法开展玉米ZmCCTs基因的结构、氨基酸特点、染色体定位及基因进化分析,还与其他物种的CCT基因家族进行对比分析.结果 表明,CCT基因家族在染色体上呈现不均匀分布,其中5号染色体分布最多(11个),3、7、10号等染色体分布最少(均只有3个).CCT基因家族具有相对保守的结构,即每个基因都包含保守的CCT DNA结构,其他少数基因舍有其他DNA结构,CCT蛋白的3D结构含有1个0α螺旋与3个B折叠.根据多物种CCT蛋白的进化树分析依据相似性将其分为8个分支,分析结果显示单子叶植物玉米与谷子、二穗短柄草CCT基因保守性更强,亲缘关系更近.本研究为进一步揭示玉米CCT基因家族的功能机制提供了相应的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵明	中国农业科学院作物科学研究所	172	4205	37.0	58.0
2	郭栋	中国农业科学院作物科学研究所	7	6	2.0	2.0
8	周宝元	中国农业科学院作物科学研究所	4	86	2.0	4.0
12	杜媚	东北农业大学农学院	1	1	1.0	1.0
13	高卓晗	东北农业大学农学院	1	1	1.0	1.0
14	曹哲统	北京化工大学生命科学与技术学院	1	1	1.0	1.0