马铃薯Shaker基因家族全基因组鉴定和分析

• 作者: 任茂智 卓凤萍 尹欢 邓可宣
• 来源期刊: 重庆科技学院学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: Shaker基因家族 马铃薯 钾离子吸收 表达模式 系统发育
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 植物研究
• 页码范围: 104-108,116
• 页数: 6页
• 分类号: Q945
• 字数: 3359字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1980.2019.03.026

摘要

钾素营养在植物的生长发育过程中具有重要作用.Shaker家族基因参与植物对低钾环境胁迫的响应过程,可帮助植物从土壤中吸收钾素.将拟南芥Shaker蛋白质序列作为源序列,在马铃薯数据库PGSC中搜索获得22个StShaker基因;通过多序列比对和保守结构域分析,最终从马铃薯基因组中鉴定出9个StShaker基因.通过分析其外显子/内含子结构、系统发育树、染色体分布、蛋白质序列等,发现StShaker基因能够分为5组,有4个保守的结构域,所有的StShaker基因在结构域I中都有一个核心的GYGD/E基序.低钾胁迫对大多数StShaker基因在转录水平上没有显著影响,StShaker可能是受转录后水平上的调控来影响马铃薯对钾离子的吸收.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卓凤萍		6	18	3.0	4.0
2	邓可宣	重庆大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
3	任茂智	重庆大学生命科学学院	7	13	3.0	3.0
4	尹欢	重庆大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0