基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性

• 作者: 丁君辉 周敏 彭晓赟 徐文忠 王若仲 萧浪涛 袁凡
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥植酸酶 水解 生物信息学 同源建模 分子对接 植酸
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 生物科学与技术
• 页码范围: 485-490,495
• 页数: 7页
• 分类号: Q754
• 字数: 4566字
• 语种: 中文

摘要

采用生物信息学、同源建模、分子对接等方法,对拟南芥植酸酶(ATMINPP)的功能结构及其与植酸的分子对接模式进行了预测.结果表明:ATMINPP由487个氨基酸组成,其二级结构由18个 α 螺旋、6个 β 折叠、伸展片段和无规则卷曲等4个主要部分构成;保守半胱氨酸在螺旋结构之间形成4个二硫键;ATMINPP蛋白有2个结构域(α/β-结构域和 α-结构域),活性位点位于2个结构域的中间;对接时,带负电的植酸结合在ATMINPP带正电的亲水性口袋内;保守序列RHGARYP中的His 66对植酸氢键所结合的磷酸基团进行亲核攻击,形成中间复合物,中间复合物水解得到磷酸和磷酸肌醇衍生物,His 343为解离基团氧原子提供质子,使得磷酸基团解离.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐文忠	中国科学院植物研究所	10	92	5.0	9.0
2	萧浪涛		3	11	2.0	3.0
3	袁凡		1	0	0.0	0.0
4	周敏		1	0	0.0	0.0
5	丁君辉		2	24	1.0	2.0
6	彭晓赟		1	0	0.0	0.0
7	王若仲		1	0	0.0	0.0