云南省2014年1株肠道病毒71型B5亚型病毒全基因组序列分析

• 作者: 向以斌 周晓芳 姜黎黎 寸建萍 徐闻
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 肠道病毒71型 B5亚型 全基因组 云南省
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 卫生健康事业发展70年巡礼专栏 手足口病专题论著
• 页码范围: 256-262
• 页数: 7页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2019.0051

摘要

目的 对2014年云南省监测的1株手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)肠道病毒71型(enterovirus 71,EV-A71) B5基因亚型分离株进行全基因组序列分析.方法 对收集到的手足口病病例粪便标本进行病毒分离培养和鉴定,对鉴定为EV-A71型B5亚型的毒株全基因组进行分段核酸扩增PCR并测定序列,获得的各段序列通过SeqMan拼接后获得全基因组序列,并与其他参考株构建遗传进化树进行基因分析.结果 获得该肠道病毒71型B5基因亚型分离株(J098/YN/CHN/2014)的全基因组序列(7 290 bp),它与B5亚型毒株同源性最高(92.4％～98.0％),未发现基因重组情况,其VP1区氨基酸在多个位点上与其他基因型参考株存在特异突变.结论 云南由EV-A71引起的手足口病仍以C4a亚型为主,但EV-A71 B5亚型毒株的出现提示应密切关注其流行变异情况,为今后手足口病的公共卫生策略提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐闻		60	312	10.0	14.0
2	寸建萍		17	77	5.0	8.0
3	姜黎黎		12	37	3.0	6.0
4	周晓芳		10	32	3.0	5.0
5	向以斌		18	83	6.0	8.0