金铁锁转录因子ptMYC2的克隆和生物信息学分析

• 作者: 孟文俊 张爱丽 朱文杰 段丽 蒋乐晓 钱子刚
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 金铁锁 转录因子 MYC2 三萜皂苷 生物合成途径 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 植物生理与育种
• 页码范围: 1350-1358
• 页数: 9页
• 分类号: Q943
• 字数: 5481字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201810005

摘要

金铁锁是"云南白药"等多种中成药的重要组成,其有效成分为三萜皂苷,MYC类转录因子在调节植物三萜类次生代谢积累中有重要作用.为研究ptMYC2基因在金铁锁三萜皂苷合成代谢途径的调控机制,该研究基于金铁锁转录组测序数据,克隆得到ptMYC2转录因子的两个全长基因;通过生物信息学软件对两条转录因子的同源性、理化性质、疏水性、跨膜结构、亚细胞定位、结构域、靶基因结合位点等进行初步预测分析.结果表明:两条转录因子所编码的蛋白属于亲水性蛋白,不存在跨膜区域,均是非分泌蛋白质,且不存在信号肽;两条转录因子的亚细胞定位于细胞核;结构域分析显示,两个基因都含有bHLH家族结构域;预测得到金铁锁三萜皂苷合成途径中HMGR、FPS、SE、β-AS等基因的启动子可能存在与MYC2结合的E-box特异性结合位点.该研究结果将为进一步研究ptMYC2基因在金铁锁三萜皂苷合成代谢途径的调节机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钱子刚	云南中医学院中药材优良种苗繁育工程中心	63	520	14.0	19.0
2	张爱丽	云南中医学院中药材优良种苗繁育工程中心	13	17	3.0	3.0
3	孟文俊	云南中医学院中药材优良种苗繁育工程中心	2	0	0.0	0.0
4	蒋乐晓	云南中医学院中药材优良种苗繁育工程中心	1	0	0.0	0.0
5	朱文杰	云南中医学院中药材优良种苗繁育工程中心	1	0	0.0	0.0
6	段丽	云南中医学院中药材优良种苗繁育工程中心	1	0	0.0	0.0