长链非编码RNA LOC441178在口腔鳞癌中的生物信息学分析

• 作者: 吴文玲 甘彬良 胡晓桦 蓝东 覃美娇 陈昕妤 颜诗白
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 口腔鳞状细胞癌 LOC441178 公共数据库 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 797-803
• 页数: 7页
• 分类号: R739.8
• 字数: 3984字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2019.05.028

摘要

目的:通过生物信息学方法分析长链非编码RNA 441178(lncRNA,LOC441178)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达意义及预测其潜在生物学功能机制.方法:利用公共数据库收集LOC441178在OSCC中的表达数据,综合分析LOC441178表达水平与OSCC临床病理特征的关系.使用DAVID 6.8生物信息学丁具对LOC441178相关基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,预测LOC441178潜在的作用机制.结果:共纳入13篇文献,包括653个OSCC样本和262个对照样本.LOC441178在OSCC组织中的表达水平显著低于对照组(SMD=-1.60),并对OSCC的诊断价值较高(AUC=0.93).GEO数据集显示LOC441178与285个基因存在相关性.GO分析显示LOC441178可能影响脂肪酸代谢功能.KEGG分析表明,LOC441178可能通过ABC转运蛋白、丙酮酸代谢、脂肪酸降解等信号通路参与OSCC进程.结论:LOC441178在OSCC组织中的表达水平显著下调,可能通过调节脂肪酸代谢在OSCC发展过程中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡晓桦	广西医科大学第一附属医院肿瘤内科	73	346	9.0	14.0
2	蓝东	广西医科大学第一附属医院肿瘤内科	23	93	6.0	8.0
3	覃美娇	广西医科大学第一附属医院肿瘤内科	1	0	0.0	0.0
4	甘彬良	广西医科大学第一附属医院肿瘤内科	3	46	2.0	3.0
5	陈昕妤	广西医科大学第一附属医院肿瘤内科	3	9	2.0	3.0
6	吴文玲	广西医科大学第一附属医院肿瘤内科	1	0	0.0	0.0
7	颜诗白	广西医科大学第一附属医院肿瘤内科	1	0	0.0	0.0