利用生物信息学发现长链非编码RNA DSCAM-AS1为肺腺癌潜在治疗靶点

• 作者: 丰雪 李红梅
• 来源期刊: 临床医药文献电子杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肺腺癌 生物信息学 生存预后 长链非编码RNA
• 年，卷（期）: 2019,（18）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 3-4,6
• 页数: 3页
• 分类号: R734.2
• 字数: 1673字
• 语种: 中文

摘要

目的 筛选肺腺癌的潜在靶点,运用生物信息学探索肺腺癌发病机制.方法 癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)收集并整理有关肺腺癌长链非编码RNA(lncRNA)的数据,利用R语言筛选癌和癌旁表达差异的lncRNA,并预测它们的靶基因,用Cytoscape软件进行基因本体(GO)分析和蛋白相互作用网络(PPI)构建.结果 1476个lncRNA在肺腺癌中差异表达,其中1230个上调,246个下调;其中表达差异最显著的是DSCAM-AS1.通过共表达网络积分分析识别出DSCAM-AS1对应的41个可能的靶基因.基因本体论富集分析发现DSCAM-AS1通过细胞信号传导、细胞新陈代谢、能量相关通路等与肺腺癌的发病有关.通过Kaplan Meier Plotter进行生存预后的分析.结论 最终确定DSCAM-AS1可能是肺腺癌潜在的治疗靶点.利用生物信息学方法能有效筛选目标基因,并可为进一步实验验证提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李红梅	青岛大学医学院	29	81	5.0	7.0
2	丰雪	青岛大学医学院	1	0	0.0	0.0