卵菌与真菌Argonaute家族基因的生物信息学分析

• 作者: 冯慧 叶文武 宣铭润 李喻菲 林龙 王源超
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 卵菌 真菌 Argonaute基因家族 RNA干扰 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 60-67
• 页数: 8页
• 分类号: S432.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000312

摘要

Argonaute蛋白广泛存在于真核生物与原核生物中,可在非编码小RNA或DNA的引导下,对完全匹配或部分匹配的靶标进行切割、翻译抑制或染色体修饰.本研究利用生物信息学对127种卵菌与真菌的基因组进行分析,旨在了解各个物种中AGO家族基因的数量、蛋白结构域、进化关系及转录模式等.结果 发现,大部分卵菌与真菌的基因组中(51％)含有2个AGO基因,而疫霉菌和壶菌等平均含有4个以上.卵菌与真菌的AGO基因在进化上相互独立,多拷贝AGO基因可能是通过基因复制形成;大部分AGO基因具有6个可预测的功能域(即:N端、Linker 1、PAZ、Linker 2、MID和PIWI),并且在PAZ和PIWI功能域上,与核酸5'和3端结合及与催化活性相关的氨基酸位点整体相对保守,仅个别位点存在一定的差异.侵染大豆过程中,大豆疫霉和终极腐霉的两对同源AGO基因具有保守的表达模式,且基因表达水平相对较高,可能具有相似的生物学功能.上述结果将为深入解析AGO介导的RNA干扰机制及生物学功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王源超		62	1051	19.0	30.0
2	叶文武		8	19	3.0	4.0
3	冯慧		2	0	0.0	0.0
4	李喻菲		1	0	0.0	0.0
5	林龙		1	0	0.0	0.0
6	宣铭润		1	0	0.0	0.0