广州市2018年输入性登革病毒4型全基因组序列特征分析

• 作者: 张周斌 景钦隆 曹毅敏 曾庆 朱娉婷 李意兰 狄飚 胡玉山 苏文哲 蒋力云 陈宗遒
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 登革病毒4型 登革热 全基因组测序 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 194-201
• 页数: 8页
• 分类号: R373.3
• 字数: 4305字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2020.00.006

摘要

目的 本文对广州市2018年输入性DENV-4型病毒的生物学来源进行分析,为本地登革热的防控提供科学依据并累积基线数据.方法 通过传染病监测网络收集广州市2018年输入性DENV-4病例,对急性期患者血清进行病毒分离培养并对分离到的DENV-4毒株进行全基因组测序、系统发生树重建和生物信息学分析.结果 共分离得到5株DENV-4毒株,其中4株由泰国和柬埔寨输入的分离株均属于DENV-4基因Ⅰ型;菲律宾输入的病例分离株与其他4株亲缘性较低,属于DENV-4基因Ⅱa型;5株分离株间的核苷酸(氨基酸)同源性为90.8％ (96.7％～96.9％);经过比对,5株分离株和6株参考株的E蛋白区域有9个位点出现差异,NS1蛋白区域有14个位点出现差异,NS5蛋白区域有25个位点出现差异.结论 本研究对广州地区输入性DENV-4毒株进行全基因组测定,间接地掌握周边国家地区DENV-4的基因特征,为本地登革热的防控和溯源提供基线数据,具有重要的公共卫生意义.