向日葵NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析

• 作者: 刘洋 宋阳 景岚 路妍
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 向日葵 NBS-LRR 抗病基因 向日葵锈病
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生物技术
• 页码范围: 441-452
• 页数: 12页
• 分类号: S432.2
• 字数: 7908字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2019243

摘要

利用生物信息学方法对向日葵基因组的蛋白质数据库进行搜索,共获得255个富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点(nucleotide binding site and leucine rich repeat,NBS-LRR)类抗病基因的蛋白质序列,并根据结构域类型,将其分为TIR和Non-TIR两类.进一步对其中42个同时含有LRR和NBS结构域的LRR-NBS型基因编码蛋白质的理化性质、氨基酸序列及基因在染色体上的物理分布进行分析,结果表明,基因多分布于4号、8号和13号染色体,而且52.4％以基因簇存在;结构域预测结果显示,该类蛋白都具有特征结构域NBS结构域,氨基酸序列同源性为29.26％.对6个NBS类基因经向日葵锈菌诱导后的表达分析表明,6个基因均可被向日葵锈菌诱导表达,说明其可能参与了向日葵响应锈菌胁迫的抗病反应过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	路妍	内蒙古农业大学园艺与植保学院	5	10	1.0	3.0
2	景岚	内蒙古农业大学园艺与植保学院	52	289	9.0	13.0
3	刘洋	内蒙古农业大学园艺与植保学院	32	109	7.0	9.0
4	宋阳	内蒙古农业大学园艺与植保学院	33	239	8.0	14.0