冠心病与生物钟关联靶基因的生物信息学挖掘

• 作者: 常晓彤 李喜龙 樊茜茜 王文栋 苏翰博
• 来源期刊: 医学研究与教育
• 学科: 医学
• 关键词: 生物钟 冠心病 生物信息学 染色体定位 富集分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 1-13
• 页数: 13页
• 分类号: R392
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674⁃490X.2020.05.001

摘要

目的 分析生物节律紊乱与冠心病发生关联的潜在分子机制.方法 从GEO数据库中获取GSE71226芯片数据,用R软件筛选冠心病差异表达基因;经文本挖掘和蛋白互作分析获得生物钟相关基因,进行功能注释、 染色体定位和互作分析.结果 获得488个冠心病差异表达基因(coronary heart disease differentially expressed genes,CHD?DEGs)和64个生物钟相关基因(biological clock related genes,BRGs),在染色体上分布密集,且多与转录调控、 炎症和免疫系统疾病相关.其中28个CHD?DEGs与22个BRGs发生了显著互作,有10个重要关联靶基因.结论 生物节律紊乱与冠心病的发生之间存在着密切的关联.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常晓彤		46	232	6.0	13.0
2	王文栋		18	37	4.0	5.0
3	苏翰博		1	0	0.0	0.0
4	樊茜茜		1	0	0.0	0.0
5	李喜龙		1	0	0.0	0.0