百脉根Hsp70s基因家族的生物信息学分析

• 作者: 吴佳海 宋莉 杨仕梅 杨芳 罗雪
• 来源期刊: 山地农业生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 百脉根 LiHsp70s基因结构 热激蛋白 生物信息学 功能预测
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2020.05.001

摘要

热激蛋白(HSPs)是细胞受逆境诱导产生的一类具有稳定蛋白质结构、修复变性蛋白和维护生物膜稳定等功能的分子伴侣,同时,在缓解植物高温伤害和提高热耐受性等方面有重要的调控作用.根据百脉根基因组数据,利用生物信息学方法对百脉根Hsp70基因(LjHsp70s)家族的基因结构、染色体分布、选择压力、顺式作用元件、表达特性和系统进化等进行分析.结果表明,LjHsp70s家族有18个成员,分为4类,它们的内含子和外显子数量为1～8,含有多个保守基序,分布在6条染色体上,编码602～703个氨基酸,均编码酸性亲水蛋白;含有激素、光照及胁迫等响应顺式作用元件,LjHsp70s在百脉根的根、茎、叶等部位均有表达,但其表达量不同;该家族基因在进化过程中主要受负选择作用,进化上较为保守,家族成员与拟南芥和烟草的Hsp70基因可分为6组,但是百脉根LjHsp70s基因仅存在于4个亚族中,表明其与拟南芥、烟草的Hsp70s基因家族成员之间进化关系密切,同时也存在一定差异.LjHsp70s基因在百脉根的各个部位均有表达,对百脉根生长发育过程起着重要的作用,研究结果为解析百脉根LjHsp70s基因功能提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴佳海		15	15	3.0	3.0
2	宋莉		6	29	4.0	5.0
3	杨芳		1	0	0.0	0.0
4	杨仕梅		1	0	0.0	0.0
5	罗雪		1	0	0.0	0.0