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摘要:
在本实验室从海南省西沙群岛海沙里分离出1株季也蒙毕赤酵母(Meyerozyma guilliermondii),并证实该酵母菌株有较好的耐盐性,在12% NaC1胁迫培养条件下仍可生长的基础上,本文通过Illumina HiSeqTM高通量测序技术对经盐胁迫培养与非盐胁迫培养24 h的M.guilliermondii进行转录组测序比较.结果 表明:2组样品共有1 027个显著性差异表达基因,其中458个基因表达上调,569个基因表达下调.通过基因本体(gene ontology, GO)功能注释发现,经盐胁迫处理后M.guilliermondii的差异表达基因主要富集在生物过程分类中,其中核苷酸代谢、糖代谢及辅酶代谢基因产生较大差异.对差异基因进行京都基因与基因组百科全书数据库(Kyoto Encyclopediaof Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,发现大部分富集通路都与细胞分裂和代谢有关,与GO富集结果相对应.上述结果可以为盐胁迫培养对M.guilliermondii的生长影响及进一步的生物学探究提供科学依据.
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内容分析
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文献信息
篇名 盐胁迫培养下季也蒙毕赤酵母的转录组学差异分析
来源期刊 浙江大学学报(农业与生命科学版) 学科 生物学
关键词 季也蒙毕赤酵母 盐胁迫 转录组学 高通量测序
年,卷(期) 2020,(4) 所属期刊栏目 生物科学与技术
研究方向 页码范围 400-406
页数 7页 分类号 Q939.9
字数 语种 中文
DOI 10.3785/j.issn.1008-9209.2019.09.091
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 郑晓冬 79 1244 18.0 31.0
2 曹璇 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
季也蒙毕赤酵母
盐胁迫
转录组学
高通量测序
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
浙江大学学报(农业与生命科学版)
双月刊
1008-9209
33-1247/S
大16开
杭州市天目山路148号 浙江大学出版社内
32-48
1956
chi
出版文献量(篇)
2752
总下载数(次)
3
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