芍药等8种植物COMT基因的生物信息学分析

• 作者: 石文波 胡蕴钰 许聪 赵大球 陶俊 高天祥
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 芍药 咖啡酸-O-甲基转移酶 生物信息学 木质素
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 2468-2474
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.018.002468

摘要

植物咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因对木质素的合成具有重要的调控作用.本研究采用生物信息学方法对芍药等8种植物COMT基因编码的氨基酸序列进行比对,进而对其蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、二级结构与三级结构进行了预测与分析.结果 表明,芍药等8种植物COMT基因编码氨基酸的一致性可达65.91％,平均相对分子量为39 437.79 Da,带有酸性等电点,含量最丰富的氨基酸为亮氨酸(Leu)和丙氨酸(Ala),无信号肽,无跨膜结构域,磷酸化位点数量最多的为丝氨酸和苏氨酸,定位于细胞骨架和细胞质中可能性最大,二级结构则以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维结构具有一定的相似性.这一结果为今后深入开展植物COMT基因功能研究提供了科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵大球		53	286	8.0	15.0
2	陶俊		106	1479	17.0	36.0
3	许聪		3	4	1.0	2.0
4	石文波		2	0	0.0	0.0
5	高天祥		1	0	0.0	0.0
6	胡蕴钰		1	0	0.0	0.0