基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
目的 探讨在小鼠肝细胞癌(HCC)微环境中花生四烯酸(AA)代谢相关内质网膜基因在HCC发生中的可能作用.方法 以AA代谢相关基因为背景,以小鼠HCC瘤体组织和癌旁组织为材料,以RNA-seq和生物信息学分析参与AA代谢的差异表达内质网膜基因(ADEGs)的功能,并用RT-qPCR验证ADEGs的表达情况.结果 HCC中共有35个ADEGs(基因表达以每百万测序碱基中每千个转录子测序碱基中所包含的测序片断数(FPKM)≥2或≤0.5且错误发现率(FDR)≤0.05);它们参与了2个生物学程序(BPs)、5个细胞组分(CCs)、9个分子功能(MFs)、1个蛋白位点序列特征(US)和6个信号通路(KPs).这些基因的功能主要集中在内质网膜上铁离子结合(IIB)对环氧化酶P450途径(EPP)的影响上.进一步分析发现,IIB中的ADEGs在HCC微环境中发生了广泛的单核苷酸位点变异(SNV)和插入、缺失(INDEL)现象,且其发生频率与基因表达正相关(r=0.83).结论 HCC微环境中的ADEGs可能通过内质网中的IIB引起EPP异常,从而在HCC发生、发展中发挥重要作用,而SNV和INDEL则可能是其中重要的基因表达调控方式.
推荐文章
花生四烯酸的ω-羟化代谢途径与心脑血管疾病
花生四烯酸
细胞色素P450
20-HETE
心脑血管疾病
花生四烯酸单乙醇酰胺的酶法制备
花生四烯酸
二次富集
花生四烯酸单乙醇酰胺
酶法制备
花生四烯酸及其代谢产物在胰岛β细胞功能及胰岛素抵抗中的作用
花生四烯酸
代谢产物
胰岛素分泌
胰岛素抵抗
胰岛a细胞功能
厚朴酚对大鼠中性白细胞花生四烯酸代谢酶的影响
厚朴酚
5-脂氧合酶
白三烯A4水解酶
环氧化酶
中性白细胞
花生四烯酸
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 花生四烯酸代谢基因 对小鼠肝细胞癌中环氧化酶P 450途径的影响
来源期刊 基础医学与临床 学科 医学
关键词 肝细胞癌 内质网膜 铁离子结合 环氧化酶P450途径
年,卷(期) 2020,(8) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 1053-1058
页数 6页 分类号 R394
字数 2772字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 梁清洋 右江民族医学院临床医学院骨科 3 0 0.0 0.0
2 倪安妮 基右江民族医学院础医学院生化教研室 1 0 0.0 0.0
3 姚鸿飞 基右江民族医学院础医学院生化教研室 1 0 0.0 0.0
4 李根亮 基右江民族医学院础医学院生化教研室 1 0 0.0 0.0
5 唐玉莲 基右江民族医学院础医学院生化教研室 1 0 0.0 0.0
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (13)
共引文献  (1)
参考文献  (6)
节点文献
引证文献  (0)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
1996(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1997(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
1999(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2000(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2002(2)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(2)
2004(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2005(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2006(2)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(1)
2009(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2016(2)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(0)
2018(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2019(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2020(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
肝细胞癌
内质网膜
铁离子结合
环氧化酶P450途径
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
基础医学与临床
月刊
1001-6325
11-2652/R
大16开
北京东单三条5号
82-358
1981
chi
出版文献量(篇)
7613
总下载数(次)
10
总被引数(次)
29500
论文1v1指导