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花生四烯酸代谢基因 对小鼠肝细胞癌中环氧化酶P 450途径的影响
花生四烯酸代谢基因 对小鼠肝细胞癌中环氧化酶P 450途径的影响
作者:
倪安妮
唐玉莲
姚鸿飞
李根亮
梁清洋
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肝细胞癌
内质网膜
铁离子结合
环氧化酶P450途径
摘要:
目的 探讨在小鼠肝细胞癌(HCC)微环境中花生四烯酸(AA)代谢相关内质网膜基因在HCC发生中的可能作用.方法 以AA代谢相关基因为背景,以小鼠HCC瘤体组织和癌旁组织为材料,以RNA-seq和生物信息学分析参与AA代谢的差异表达内质网膜基因(ADEGs)的功能,并用RT-qPCR验证ADEGs的表达情况.结果 HCC中共有35个ADEGs(基因表达以每百万测序碱基中每千个转录子测序碱基中所包含的测序片断数(FPKM)≥2或≤0.5且错误发现率(FDR)≤0.05);它们参与了2个生物学程序(BPs)、5个细胞组分(CCs)、9个分子功能(MFs)、1个蛋白位点序列特征(US)和6个信号通路(KPs).这些基因的功能主要集中在内质网膜上铁离子结合(IIB)对环氧化酶P450途径(EPP)的影响上.进一步分析发现,IIB中的ADEGs在HCC微环境中发生了广泛的单核苷酸位点变异(SNV)和插入、缺失(INDEL)现象,且其发生频率与基因表达正相关(r=0.83).结论 HCC微环境中的ADEGs可能通过内质网中的IIB引起EPP异常,从而在HCC发生、发展中发挥重要作用,而SNV和INDEL则可能是其中重要的基因表达调控方式.
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篇名
花生四烯酸代谢基因 对小鼠肝细胞癌中环氧化酶P 450途径的影响
来源期刊
基础医学与临床
学科
医学
关键词
肝细胞癌
内质网膜
铁离子结合
环氧化酶P450途径
年,卷(期)
2020,(8)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1053-1058
页数
6页
分类号
R394
字数
2772字
语种
中文
DOI
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作者信息
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姓名
单位
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被引次数
H指数
G指数
1
梁清洋
右江民族医学院临床医学院骨科
3
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倪安妮
基右江民族医学院础医学院生化教研室
1
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姚鸿飞
基右江民族医学院础医学院生化教研室
1
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李根亮
基右江民族医学院础医学院生化教研室
1
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唐玉莲
基右江民族医学院础医学院生化教研室
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内质网膜
铁离子结合
环氧化酶P450途径
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
基础医学与临床
主办单位:
北京生理科学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-6325
CN:
11-2652/R
开本:
大16开
出版地:
北京东单三条5号
邮发代号:
82-358
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
7613
总下载数(次)
10
总被引数(次)
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