蓖麻NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析

• 作者: 代梦媛 李文昌 高梅
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 蓖麻 抗逆性 NAC转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 1808-1817
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.018.001808

摘要

NAC蛋白是植物特有的转录因子大家族,作用于植物生长发育和逆境胁迫响应,本研究基于蓖麻全基因组数据,利用生物信息学分析方法对蓖麻NAC转录因子家族成员、系统发育、编码蛋白的结构和理化性质进行分析.蓖麻NAC转录因子家族包括91个成员,分为14个亚族,其中蓖麻NAC转录因子Ⅻ亚族和Ⅻ亚族为蓖麻特有NAC蛋白;基因结构分析显示内含子数量为2～5个,Ⅻ亚族中12个成员缺少内含子;蛋白结构域分析显示Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四个亚族蛋白质序列5个结构域(Motif)保守性较强,motif2几乎存在所有蓖麻NAC蛋白中;与拟南芥105个NAC成员构建系统发育进化树,蓖麻58个NAC蛋白分别聚类到38个OGs,NAC转录因子的40个OGs中蓖麻缺少OG3b和OG7f;理化性质和结构分析显示蓖麻NAC蛋白质绝大多数是亲水氨基酸,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构大部分相似.蓖麻具有很强的抗逆境胁迫能力,本研究为蓖麻耐性相关的NAC转录因子调控机理研究提供了科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高梅		12	39	4.0	6.0
2	李文昌		23	141	7.0	11.0
3	代梦媛		8	15	3.0	3.0