基于全基因组测序的阪崎克罗诺杆菌婴幼儿食品分离株分子特征研究

• 作者: 张红芝 陈雯杰 刘雪薇 魏滕 鲁珺琰 张曦
• 来源期刊: 中国食品卫生杂志
• 关键词: 阪崎克罗诺杆菌 全基因组测序 多位点序列分型 全基因组多位点序列分型 毒力基因 耐药基因 婴幼儿食品
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告|Study Reports
• 页码范围: 138-143
• 页数: 6页
• 分类号: R155
• 语种: 中文
• DOI: 10.13590/j.cjfh.2021.02.003

摘要

目的 研究婴幼儿食品中分离的阪崎克罗诺杆菌(C.sakazakii)分子生物学特征.方法 对婴幼儿食品中C.sakazakii进行分离鉴定、药物敏感性试验和全基因组测序,利用BioNumerics软件对全基因组数据进行拼接组装,对组装基因组开展多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、毒力基因和耐药基因分析,并与PubMLST数据库中ST型进行比较分析.结果 本研究中分离的9株C.sakazakii共分为5个ST型,ST1和ST64型为主要型别,同时也是PubMLST数据库中C.sakazakii的主要型别.3株C.sakazakii携带mcr-9耐药基因,但药敏结果显示所有菌株对包括多粘菌素B和多粘菌素E在内的12种抗生素均敏感.除携带共同毒力基因谱外,ST1、ST64和ST458型携带脂多糖基因gtrB.cgMLST聚类分析显示,9株C.sakazakii呈高度多样性.结论 与临床分离株相关的ST1和ST64型是本研究食品分离株中的主要型别,提示C.sakazakii具有潜在的致病性,有必要对婴幼儿食品中C.sakazakii开展连续监测,为预防控制由其引起的食源性疾病提供依据.