黄花蒿bZIP转录因子基因家族及光调控表达模式分析

• 作者: 王星文 吴端 师玉华 张栋 丁丹丹 马婷玉 向丽
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 关键词: 黄花蒿 bZIP转录因子 光调控 表达分析
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 专题讨论一:中药研究|Thematic Dicussion I:Chinese Materia Medica
• 页码范围: 20-32
• 页数: 13页
• 分类号: R285
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.20200419002

摘要

目的 碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是青蒿素生物合成途径中的重要调控因子,本研究利用生物信息学手段鉴定黄花蒿全基因组bZIP转录因子家族成员并对其在光调控下表达模式进行分析,为进一步探索AabZIP转录因子功能及其对青蒿素合成途径的调控机制提供参考依据.方法 以BLAST、Hmmsearch程序及Pfam数据库对黄花蒿基因组中bZIP基因进行筛选及鉴定,MAGA7.0软件、GSDS2.0、meme、ExPASy等在线工具对AabZIP家族进化关系、基因结构、保守结构域、蛋白理化性质等生物学信息进行分析,利用TBtools软件分析AabZIP基因在光调控下基因特征.结果 全基因组水平上共鉴定出78条AabZIP家族成员,基于拟南芥分组将其分为10个亚族和1个未分组成员(AabZIP78),其中S亚族数量最多,有22条(28.2％);AabZIP基因结构较为保守,78条AabZIP基因中发现14组同源基因序列,其中13对受到纯化选择影响;除AabZIP78与番茄bZIP保守基序一致外,其余序列均与拟南芥bZIP保守基序一致;不同光照胁迫下基因表达水平存在较大差异,其中A、G、H及S亚族中大部分成员在蓝光胁迫下高表达.结论 AabZIP响应光调控并参与复杂的青蒿素代谢途径,本研究可为进一步深入研究黄花蒿中bZIP转录因子基因进化、功能及光调控响应机制等奠定基础.