八肋游仆虫NMD途径因子的生物信息学分析及分子鉴定

• 作者: 周宝春 王软林 柴宝峰
• 来源期刊: 山西大学学报（自然科学版）
• 关键词: 八肋游仆虫 无义mRNA降解途径 结构预测 分子对接 功能结构域注释
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学与环境科学|Life and Environment Sciences
• 页码范围: 167-176
• 页数: 10页
• 分类号: Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.13451/j.sxu.ns.2019140

摘要

无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是细胞内基因表达调控的一种重要方式,以保障细胞内基因的精确表达,但无义mRNA被识别和降解的机制有待深入研究.文章利用同源序列比对,从八肋游仆虫大核基因组数据库中鉴定了11种NMD途径相关蛋白因子的基因序列,并预测了各个蛋白因子的功能结构域;利用蛋白质三级结构预测与分子对接技术,分析了八肋游仆虫eUPF-CH与eUPF2-U1BD之间相互作用的关键氨基酸残基.利用定点突变和Pulll-down实验证实,eUPF2可能通过其保守的αA-helix结构域与eUPF1相互作用.