全基因组挖掘与分析类芽孢杆菌SSG-1的甘露聚糖水解酶

• 作者: 彭婕 乔晋楠 李文馨 张义阳 张山 乔代蓉 曹毅
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 关键词: 类芽孢杆菌 甘露聚糖酶 基因组 生物信息分析
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1441-1447
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2020.07066

摘要

甘露聚糖(mannan)是半纤维素中含量仅次于木聚糖的难水解多糖,发掘将甘露聚糖水解为甘露寡糖的甘露聚糖降解酶,对实现其在生物能源、制药、食品、饲料、制浆造纸和纺织等领域的应用,具有极其重要的意义.类芽孢杆菌是甘露聚糖水解酶的新酶源,但鲜见产甘露聚糖酶的报道.利用从土壤中分离获得的产琼胶酶类芽孢杆菌SSG-1的全基因组数据,采用生物信息技术,从全基因组角度挖掘其甘露聚糖水解酶.共挖掘获得6条甘露聚糖水解酶,经Pfam、CDD和分子进化分析,WP 089548806.1为GH26家族的内切β-1,4-甘露聚糖酶,WP_089549173.1和WP_089548729.1为GH76家族的α-1,6-甘露聚糖酶,WP_089547966.1、WP_089548481.1和WP_009225474.1为GH2家族的β-甘露糖苷酶.其中,WP_089548806.1和WP_089548729.1为分泌蛋白,多序列比对和结构分析表明WP_089548806.1具有内切β-1,4-甘露聚糖酶保守的底物结合和活性位点,具有β-甘露聚糖酶典型的(β/α)8-TIM桶状结构.本研究成功从类芽孢杆菌SSG-1中挖掘出6个新型甘露聚糖水解酶,可为挖掘新型甘露聚糖水解酶资源以及揭示类芽孢杆菌SSG-1甘露聚糖酶的表达调控机制奠定重要基础.