绿豆Dof家族基因的生物信息学分析及盐胁迫下的表达分析

• 作者: 张文慧 杜吉到 贺登美 谷心茹 黄勇 国凤双
• 来源期刊: 西南农业学报
• 关键词: 绿豆 Dof基因 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源|CROP GENETICS & BREEDING · GERMPLASM RESOURCES
• 页码范围: 1173-1180
• 页数: 8页
• 分类号: S522
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2021.6.006

摘要

[目的]Dof家族基因是植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育、细胞的防御反应等方面具有重要的调控作用.[方法]本文从绿豆转录组数据库中筛选出41条Dof基因,对其蛋白序列进行生物信息学分析和盐胁迫下表达分析.[结果]Dof基因分布在除6号染色体外的1～11号染色体上,都具有1个高度保守的结构域;Dof蛋白含有5～28个磷酸化位点,并且都定位在细胞核里;系统进化分析将Dof基因分为8个组别,分析发现相同组别的Dof基因有相似的基因结构和蛋白基序,而不同组别间则存在差异;Dof基因能够响应盐胁迫,但不同胁迫时间基因间的表达模式存在差异,同组别的基因表达模式存在一定程度的相似性.[结论]相同组别的Dof基因具有相似的基因结构和蛋白基序,推测它们有相似的生物学功能.Dof基因能够不同程度响应盐胁迫,说明它们在绿豆抵御盐胁迫中发挥不同作用,这些分析结果将为绿豆Dof基因功能研究提供参考.