香蕉SUT基因家族的全基因组鉴定及其在不同低温胁迫下的表达

• 作者: 许小琼 张春渝 陈晓慧 张梓浩 林玉玲 陈振光 赖钟雄
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 关键词: 香蕉 蔗糖转运蛋白 基因家族 全基因组鉴定
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1616-1625
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2020.08004

摘要

为探究香蕉蔗糖转运蛋白(sucrose/H+ cotransporter或sucrose transporters,SUCs或SUTs)家族成员的分子特性及其在低温胁迫下的表达模式,采用生物信息学方法鉴定香蕉蔗糖转运蛋白基因家族成员,并进行蛋白结构域及特性、基因及蛋白序列组分、分子进化树、基因启动子顺式作用元件以及在不同低温处理下表达模式的分析.结果 显示:香蕉A(Musa acuminata)基因组与香蕉B(Musa balbisiana)基因组中各存在6条SUT基因,分别命名为MaSUT1-6、MbSUT1-6,且均分为三大类:SUT2、SUT3、SUT4;根据基因序列组分分析可知,MaSUT的GC含量低于MbSUT的GC含量,且二者均低于水稻SUT基因的GC含量;蛋白互作显示,MaSUT、 MbSUT成员可与多种蛋白存在互作关系;MaSUT家族成员启动子包含激素、光、非生物胁迫响应相关元件,且该家族成员均包含光响应元件;MaSUT、 MbSUT基因成员在不同低温胁迫处理下存在表达显著下调(4℃)、表达显著上调(28℃、13℃、4℃)以及在各温度处理下均不表达的5种表达模式,而MaSUT1-2、MaSUT4、MbSUT1、MbSUT3-4在低温(13℃、4℃、0℃)处理下表达量均高于对照(28℃),MaSUT3和MbSUT2在低温处理下表达量则相对下降.本研究表明香蕉A、B基因组的SUT家族成员功能具有差异性,并且部分成员可能在香蕉响应低温胁迫的过程中发挥重要作用.