基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
目的:探讨肝癌组织中细胞分裂周期蛋白20(CDC 20)的表达及临床预后价值。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肝癌转录组和临床数据,使用R和Perl软件进行数据分析整理,采用Wilcoxon秩和检验分析基因CDC20的差异表达以及与临床病理特征相关性,Kaplan-Meier和Cox回归分析肝癌患者预后影响因素。基因集富集分析(GSEA)方法分析基因CDC20的调控网络,探究潜在机制。计数资料比较采用 χ2检验。 结果:基因CDC20在肝癌组织中的表达量显著高于正常组织[5.25(2.19,13.59)比0.21 (0.14,0.37), Z=-11.0, P<0.01],其高表达与患者的不良预后显著相关( P<0.01);CDC20表达量与肿瘤的组织学分级(G1/G2/G3/G4分别为2.43(0.89,9.39)比4.51(1.53,10.55)比8.79(3.85,19.08)比15.12(4.42,25.10), Z=-2.69, P<0.01)、临床分期(Ⅰ+Ⅱ/Ⅲ+Ⅳ为4.70(2.16,10.57)比8.54(3.04,19.97), Z=-2.78, P<0.01)以及TNM分期中的T分期(T1/T2/T3/T4为3.95(1.57,9.13)比7.77(3.05,16.05)比8.54(1.86,20.79)比12.36(4.34,27.70), Z=-3.98, P<0.01)成正相关;GSEA分析提示,CDC20参与了细胞周期、DNA复制、肿瘤、泛素介导蛋白水解作用、Notch等信号通路;基因CDC20可作为评估患者预后的独立风险因子,可用于肝癌的诊断和预后判断。 结论:CDC20在肝癌组织中高表达,与患者的不良预后密切相关,可作为肝癌预后的独立危险因子,其可能通过p21蛋白泛素化降解和Notch信号通路在肝癌中发挥促癌作用。
推荐文章
生物信息学分析肝癌干细胞中致瘤基因表达的差异
干细胞
肿瘤干细胞
肝癌
致瘤基因
生物信息学
信号通路
生物功能
细胞培养
差异基因
基因芯片
组织工程
肝癌相关差异表达基因的生物信息学分析及蛋白互作网络构建
生物信息学分析
肝癌
差异基因表达
功能富集
小麦细胞分裂素受体基因TaHK1的生物信息学及表达特性分析
小麦
细胞分裂素受体
TaHK1
生物信息学分析
基因表达
OAT在非小细胞肺癌中的表达及生物信息学分析
鸟氨酸氨基转移酶
肺肿瘤
表达
生物信息学
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 基于生物信息学分析细胞分裂周期蛋白20在肝癌中的表达及预后意义
来源期刊 中华实验外科杂志 学科
关键词 肝癌 细胞分裂周期蛋白20 癌症基因组图谱 预后 基因集富集分析
年,卷(期) 2021,(10) 所属期刊栏目 肝脏外科
研究方向 页码范围 1884-1886
页数 3页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.cn421213-20210723-00562
五维指标
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (102)
共引文献  (5)
参考文献  (23)
节点文献
引证文献  (0)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
1992(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2001(1)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(1)
2002(5)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(5)
2003(4)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(4)
2004(4)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(3)
2005(3)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(3)
2006(5)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(5)
2007(7)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(7)
2008(8)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(8)
2009(11)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(9)
2010(8)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(7)
2011(10)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(9)
2012(14)
  • 参考文献(4)
  • 二级参考文献(10)
2013(14)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(12)
2014(9)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(9)
2015(8)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(6)
2016(3)
  • 参考文献(2)
  • 二级参考文献(1)
2017(4)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(1)
2018(2)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(1)
2019(3)
  • 参考文献(3)
  • 二级参考文献(0)
2020(1)
  • 参考文献(1)
  • 二级参考文献(0)
2021(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
肝癌
细胞分裂周期蛋白20
癌症基因组图谱
预后
基因集富集分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华实验外科杂志
月刊
1001-9030
42-1213/R
大16开
武汉市东湖路165号
38-85
1984
chi
出版文献量(篇)
17168
总下载数(次)
19
总被引数(次)
69898
论文1v1指导