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基于生物信息学分析细胞分裂周期蛋白20在肝癌中的表达及预后意义
基于生物信息学分析细胞分裂周期蛋白20在肝癌中的表达及预后意义
作者:
吴昊
张智鑫
张锦锐
白易
张雅敏
沈中阳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肝癌
细胞分裂周期蛋白20
癌症基因组图谱
预后
基因集富集分析
摘要:
目的:探讨肝癌组织中细胞分裂周期蛋白20(CDC 20)的表达及临床预后价值。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肝癌转录组和临床数据,使用R和Perl软件进行数据分析整理,采用Wilcoxon秩和检验分析基因CDC20的差异表达以及与临床病理特征相关性,Kaplan-Meier和Cox回归分析肝癌患者预后影响因素。基因集富集分析(GSEA)方法分析基因CDC20的调控网络,探究潜在机制。计数资料比较采用 χ2检验。 结果:基因CDC20在肝癌组织中的表达量显著高于正常组织[5.25(2.19,13.59)比0.21 (0.14,0.37), Z=-11.0, P<0.01],其高表达与患者的不良预后显著相关( P<0.01);CDC20表达量与肿瘤的组织学分级(G1/G2/G3/G4分别为2.43(0.89,9.39)比4.51(1.53,10.55)比8.79(3.85,19.08)比15.12(4.42,25.10), Z=-2.69, P<0.01)、临床分期(Ⅰ+Ⅱ/Ⅲ+Ⅳ为4.70(2.16,10.57)比8.54(3.04,19.97), Z=-2.78, P<0.01)以及TNM分期中的T分期(T1/T2/T3/T4为3.95(1.57,9.13)比7.77(3.05,16.05)比8.54(1.86,20.79)比12.36(4.34,27.70), Z=-3.98, P<0.01)成正相关;GSEA分析提示,CDC20参与了细胞周期、DNA复制、肿瘤、泛素介导蛋白水解作用、Notch等信号通路;基因CDC20可作为评估患者预后的独立风险因子,可用于肝癌的诊断和预后判断。 结论:CDC20在肝癌组织中高表达,与患者的不良预后密切相关,可作为肝癌预后的独立危险因子,其可能通过p21蛋白泛素化降解和Notch信号通路在肝癌中发挥促癌作用。
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篇名
基于生物信息学分析细胞分裂周期蛋白20在肝癌中的表达及预后意义
来源期刊
中华实验外科杂志
学科
关键词
肝癌
细胞分裂周期蛋白20
癌症基因组图谱
预后
基因集富集分析
年,卷(期)
2021,(10)
所属期刊栏目
肝脏外科
研究方向
页码范围
1884-1886
页数
3页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.cn421213-20210723-00562
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预后
基因集富集分析
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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中华实验外科杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-9030
CN:
42-1213/R
开本:
大16开
出版地:
武汉市东湖路165号
邮发代号:
38-85
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
17168
总下载数(次)
19
总被引数(次)
69898
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