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云南农业大学学报(自然科学)期刊
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小麦CesA基因家族鉴定及特征分析
小麦CesA基因家族鉴定及特征分析
作者:
吴兴阳
胡义锋
马东方
刘易科
方正武
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
小麦
纤维素合成酶(CesA)
生物信息学分析
基因表达谱
摘要:
[目的]系统鉴定和分析小麦纤维素合成酶(CesA)基因家族成员,为进一步阐明小麦CesA基因家族的生物学功能奠定理论基础.[方法]利用生物信息学方法在小麦全基因组上系统鉴定小麦CesA?(TaCesA)基因家族的成员.对小麦CesA基因的系统发育、染色体位置和转录组进行分析.预测TaCesAs基因结构、保守基序、顺式元件、蛋白质特征和亚细胞定位,并对小麦及其亚基因组供体中CesAs同源基因进行比对.[结果]共鉴定出21个TaCesA基因,分为3组(a、b和c).基因结构分析发现TaCesA含有多个内含子,但部分基因非翻译区(UTR)结构存在缺失.TaCesA基因与其亚基因组供体关系保守.TaCesAs的上游包含45个与生物胁迫/非生物胁迫、生长发育和植物激素相关的元件,预示这些基因可能参与响应小麦的生物学功能.表达谱结果显示:TaCesA基因在缺磷、高温、低温、干旱、条锈病、白粉病和赤霉病等逆境胁迫中均有响应.[结论]小麦CesA基因具有保守的基因结构和蛋白结构,且在小麦抵御非生物和生物胁迫中起着重要作用.
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文献信息
篇名
小麦CesA基因家族鉴定及特征分析
来源期刊
云南农业大学学报(自然科学)
学科
农学
关键词
小麦
纤维素合成酶(CesA)
生物信息学分析
基因表达谱
年,卷(期)
2022,(2)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
203-213
页数
11页
分类号
S512.1032
字数
语种
中文
DOI
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小麦
纤维素合成酶(CesA)
生物信息学分析
基因表达谱
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
云南农业大学学报(自然科学)
主办单位:
云南农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-390X
CN:
53-1044/S
开本:
大16开
出版地:
昆明黑龙潭云南农业大学
邮发代号:
64-16
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
3500
总下载数(次)
4
总被引数(次)
31626
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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