肝细胞癌中异常甲基化差异表达基因的生物信息学分析

• 作者: 张亚威 张帆
• 来源期刊: 河南大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 肝细胞癌 生物信息学 甲基化 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 53-63
• 页数: 11页
• 分类号: R512.6
• 语种: 中文

摘要

肝细胞癌是全球常见的高死亡率癌症之一,为找到可以作为其诊断和治疗的生物标志物,通过GEO数据库中的相关数据分析,获取异常甲基化差异表达基因;其中,甲基化下调表达上调的交集基因68个,甲基化上调表达下调的交集基因59个.对所获取的基因进行功能和通路富集分析,进而阐明与肝细胞癌相关的生物学功能及通路;构建蛋白互作网络并对其进行可视化,然后根据连接度筛选出10个hub基因,通过TCGA数据库验证后得到其中7个hub基因(ITPR1、ITGB1、UBR4、DYNC1、ANK1、PRKCA和NTRK2)更具可信度,可作为未来肝细胞癌精准诊断和治疗的异常甲基化生物标志物.