广西猫杯状病毒全基因组序列测定及其遗传进化分析

• 作者: 丁仰保 何剑桥 刘林林 余良政 崔柏杨 周华波 韦祖樟 欧阳康 黄伟坚 陈樱
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猫杯状病毒 全基因组 ORF2基因 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research articles
• 页码范围: 67-73
• 页数: 7页
• 分类号: S852.62
• 语种: 中文

摘要

为了掌握广西猫杯状病毒(FCV)的流行情况及其变异规律.本研究于2018年3月至2019年9月采集疑似FCV鼻拭子59份,其中阳性检出率49.2％(29/59).将阳性病料接种CRFK细胞,成功分离获得一株FCV毒株,命名为NN01-19.为深入了解其遗传进化规律和分子特征,本研究通过RT-P C R方法扩增获得该毒株的全基因组序列,并对其ORF2基因进行了遗传进化和序列分析.结果表明,NN01-19毒株基因组全长7709 bp,其中ORF2基因全长2010 bp.遗传进化分析发现该毒株与广西早期分离株GX01-13同属基因I群,但核苷酸和氨基酸同源性仅为77.9％和86.5％.其中,超变区(E区)抗原线性表位新增T448A、T450G、G451Q和T454S四个突变位点.重要的是,该区域还发生了V430T的突变,符合VS-FCV致病性氨基酸突变特点.本研究为深入了解FCV的流行特点及其变异规律提供了参考依据,同时也为今后防控FCV提供了重要的理论基础.