基于生物信息学探讨中药调节铁死亡干预肝癌的用药规律

• 作者: 姚元谦 刘英 杨玉雯 吕建林 黄晶晶
• 来源期刊: 广西大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 铁死亡 肝癌 生物信息学 用药规律
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 235-244
• 页数: 10页
• 分类号: R285
• 语种: 中文
• DOI: 10.13624/j.cnki.issn.1001-7445.2022.0235

摘要

为了探讨中药调节铁死亡干预肝癌的化合物及用药规律,通过FerrDb、TCGA数据库及R软件,获取肝癌中铁死亡差异靶点并进行富集分析.以ADME参数和Lipinski规则为过滤条件,利用TCMSP平台筛选可作用于差异靶点的化合物及中药,并构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络.运用中医传承计算平台对用药规律进行分析.借助AutoDock Vina软件将网络中核心化合物与作用靶点进行分子对接,以评估其结合强度.结果表明:共获得84个差异靶点,其中13个靶点可匹配到化合物,共收集到103个候选化合物及277味中药.富集分析得出铁死亡、花生四烯酸代谢、血管内皮生长因子(VEGF)、哺乳动物雷帕霉素靶点蛋白(mTOR)等信号通路.用药规律分析显示,药性以寒、温、平为主,药味以苦、辛、甘味最多,归经则以肝经、肺经、脾胃经、肾经常见,中药功效以清热解毒类、补虚类、活血化瘀类为主.48组分子对接得分均小于-4.25 kcal/m11ol,平均得分为-8.38 kcal/mol.本次研究系统分析了中药调节铁死亡治疗肝癌的用药规律,并初步分析了铁死亡干预肝癌的作用机制,可为后续中药调节铁死亡的基础研究提供思路.