基于铁死亡相关基因的口腔鳞状细胞癌的生物信息学分析

• 作者: 晏子钦 魏明波 程波
• 来源期刊: 临床口腔医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 口腔鳞状细胞癌 铁死亡 生物信息学 差异表达 GO富集 KEGG富集 蛋白质相互作用
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 19-22
• 页数: 4页
• 分类号: R739.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-1634.2022.01.006

摘要

目的:探究铁死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌(OSCC)发生发展中的作用,初步确定潜在生物标志物.方法:从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载头颈部鳞状细胞癌相关临床数据并筛选得到OSCC相关数据.利用R软件筛选差异表达的铁死亡相关基因并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析.利用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络并利用R软件筛选关键基因.对关键基因进行Kaplan-Meier生存曲线绘制和Cox回归分析.结果:共筛选出44个铁死亡相关差异表达基因,进一步分析发现9个关键基因,其中IFNG和EGFR在OSCC组织中的表达水平与生存率显著相关(P<0.05).结论:铁死亡相关基因IFNG和EGFR可作为口腔鳞状细胞癌患者预后潜在的标志物.