三种miRNA对肝癌预后预测的生物信息学分析模型

• 作者: 林思其 张泽鑫 夏睿琪 刘紫凤 陈林静 陈栩静 陈祎琦
• 来源期刊: 医学信息
• 学科: 医学
• 关键词: 肝细胞癌 microRNA 预后 TCGA
• 年，卷（期）: 2022,（3）
• 所属期刊栏目: 论著|Treatise
• 页码范围: 81-85
• 页数: 5页
• 分类号: R735.7|R318.04
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-1959.2022.03.019

摘要

目的 通过TCGA数据库构建一种miRNA预后模型,预测肝癌的预后.方法 通过edgeR软件包对miRNA和mRNA的表达数据进行分析和标准化,并与生存率相结合分为两组.通过单因素和多因素Cox回归分析构建3种与总生存率明显差异相关的miRNA,使用ROC曲线评价其可靠性.通过miRDB、TargetScan和miR TarBase 3个数据库筛选出miRNA的靶基因,并运用GO和KEGG探究其相关作用机制.使用Cytoscape3.7.2和String数据库筛选出前10个中枢基因.结果 共筛选出47个靶基因与生存预后显著相关;ROC曲线结果显示,三组的AUC分别为0.789、0.730、0.763,说明模型预测HCC患者预后的能力;回归分析显示,该模型可独立影响肿瘤的预后情况,包括T分期、临床分期及远处转移的存在.结论 has-miR-3682-3p、has-miR-9-5p和has-miR-139-5p三种miRNA的生物学分析模型可以预测HCC患者的预后,且可以作为HCC中独立的预后因素.