甘薯多酚氧化酶cDNA的克隆及序列分析

• 作者: 彭世清 陈守才
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘薯 多酚氧化酶 cDNA 序列分析 同源性分析
• 年，卷（期）: 2002,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 241-245
• 页数: 5页
• 分类号: S53
• 字数: 3530字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2002.03.008

摘要

植物多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)是一类核编码的铜金属酶,含有2个保守的铜结合区域(CuA和CuB),N端和C端部分缺乏明显的同源性.根据植物PPO的结构特点,从2个保守的铜结合区域的氨基酸序列设计一对简并引物,扩增了甘薯(Ipomoea batatas L.)PPO保守区之间的cDNA片段,测序表明该片段含595bp,编码195个氨基酸,推导的氨基酸序列包含了植物PPO的2个保守的铜结合区域,与葡萄(Vitis vinifera)、番茄(Lycopersicon esculentum)、马铃薯(Solanumtuberosum)和蚕豆(Vicia faba)PPO保守区的同源性分别为71.3%、80.8%、79.8%、70.6%.在此基础上设计引物通过3'RACE和5'RACE的方法获得了甘薯PPO cDNA的3'端和5'端的片段.最后根据保守区的cDNA片段、3'RACE片段和5'RACE片段的序列信息进行拼接,推导出甘薯PPO cDNA的全部序列信息.结果表明:甘薯PPO cDNA全长含1 984bp,有完整的阅读框,编码588个氨基酸.另外5'非翻译区16bp,3'非翻译区202 bp,其中包括1个多聚腺苷酸化信号AATAAA,以及1个含17个腺苷酸的ploy(A)尾.由甘薯PPO cDNA推导的氨基酸序列与由葡萄、番茄、马铃薯和蚕豆PPO cDNA推导的氨基酸序列进行比较,它们之间存在较明显的同源性,同源性分别为49%、48%、47%和49%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭世清	中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室	61	645	14.0	23.0
2	陈守才	中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室	31	472	14.0	20.0